藥師巖摩崖造像沿著(zhù)山腰開(kāi)鑿。現存佛龕造像基本都是明清開(kāi)鑿或者在原來(lái)造像的基礎上妝塑，而在這些造像中間，偶爾會(huì )看到一兩處唐代的造像痕跡。可能這里的巖面上原來(lái)都曾布滿(mǎn)了唐代的造像，但因為毀損以及自然的風(fēng)化，明代正統、嘉靖大規模重新開(kāi)鑿修葺時(shí)，便把原來(lái)唐的造像都抹去了。這種現象從明代造像的題記中可以得到印證，如：
唐代大佛龕中右壁上側有明正統七年頂新莊嚴藥師古佛以及彩塑童子的記載，下側有明弘治十年中峰寺釋子真亮自備衣資命匠鐫石海幔佛堂一間的記載以及嘉靖十五年莊塑佛像的題記。其余的還有嘉靖十一年大邑縣沐德鄉人張滿(mǎn)秀等舍家財鐫莊阿彌陀佛、韋陀尊天、羅漢二位的題記，嘉靖十二年信士周真容施財命匠鐫莊燃燈佛一等的題記，嘉靖十八年信士周萬(wàn)年鐫莊旗龍童子左右二位的題記以及明萬(wàn)歷三十二年，信徒莊彩佛像的墨書(shū)題記。
在這些明代造像題記中間還殘存有一些唐代比丘造觀(guān)音菩薩、地藏菩薩供養的題記。這些造像題記都說(shuō)明，明代中期藥師巖佛事活動(dòng)鼎盛，信眾僧尼紛紛來(lái)此處舍財發(fā)愿莊嚴佛像，這應該是藥師巖自唐初建后的第二次造像高潮。雖然題記中也殘存有大量南宋的游人題記，但在五代、宋時(shí)藥師巖是否有過(guò)新的造像活動(dòng)未為可知。
保護范圍：造像分布范圍外延20米內。
建設控制地帶：保護范圍外延30米。