始建于梁天監二年(503)，距今已1400多年。唐代興盛佛教，德宗時(shí)翰林學(xué)士陸贄舍宅筑基，名福業(yè)院，后改稱(chēng)報國院。宋代大中祥符元年(1008)改稱(chēng)承天院，政和七年(1117)改稱(chēng)能仁院。元順帝至正十六年(1356)毀于兵燹，明洪武二十四年(1391)改稱(chēng)為能仁教寺，正統二年(1437)重修，清乾隆二年(1737)稱(chēng)能仁禪寺。
能仁寺殿宇宏偉，氣勢雄渾，四周環(huán)水，占地70余畝。寺院座北朝南，略顯長(cháng)方形，主要建筑物分布于一條南北軸線(xiàn)及其東西兩側，山門(mén)直對天仙橋。山門(mén)往北為金則殿、大雄寶殿、華嚴閣。金剛殿前有參天銀杏兩株及磚塔一對。大殿東偏為紀念陸贄建有宣公祠，西偏為魯班殿、功德林。大殿前為鐘樓和鼓樓。寺院周?chē)科宀迹U室羅列。共有十二禪房，僧眾百余人，為遠近聞名的大寺院。
能仁寺閱歷千載，幾經(jīng)興衰，也有許多感人故事。清朝未年，一場(chǎng)無(wú)情大火，能仁寺又不幸被毀。當時(shí)中醫沈季良妻邱氏身披袈裟，背負韋馱佛像，手持木魚(yú)沿街三步一跪叩至外埠南當鎮化緣集資，歷經(jīng)49天，終于感動(dòng)富室獲得資助，重建大雄寶殿。1938年日軍入侵，能仁寺又被大火焚毀。幸存的遺址只有華嚴閣臺基與蠶皇殿，近年有關(guān)單位進(jìn)行重建。不久我們可重見(jiàn)能仁寺昔日的雄姿。